临床医学系正式成立于2010年，是山东医学高等专科学校的重点建设系部之一；临床医学专业是1966年设置，1998年被列为学校重点建设专业，2007年被评为山东省特色专业，至今已有40余年办学历史。2012年7月初，山东省教育厅公布《高等职业学校专业骨干教师国家级培训2011年度第一批项目》名单中，我校临床医学系申报的《医药卫生类临床医学专业技能与职业教育水平提高培训项目》名列其中，在目前获批的所有培训基地中，我校是山东省唯一临床医学专业培训基地。根据市场需求，近年来临床医学系以就业为导向，合理设置专业，积极拓宽专业口径，优化专业结构。以临床医学专业为龙头，带动辐射临床医学其它专业方向的发展，目前设有临床医学专业、临床医学-全科医学方向、妇幼保健方向、眼视光学方向、康复医学方向、影像诊断方向、超声诊断方向、临床医学-医院信息管理方向等专业，不断满足市场需求。自开设以来为社会培养了一大批具有临床思维能力，毕业后能够扎根基层医疗单位从事医疗、预防、保健、康复、健康教育为一体的基层卫生工作的高素质实用型医学人才。学生毕业后直接服务于城市社区和乡镇基层医疗卫生保健等单位，是目前就业面最广泛的专业。

临床医学系拥有一支教学经验丰富、临床技能扎实、科研能力较强的优秀教师队伍。现有专任教师58名，其中教授9名，副教授18名；硕士研究生20余名，博士研究生2名，在读博士3名，双师型教师达100%。其中5名教师分别被泰山医学院、潍坊医学院和延边大学医学院聘为硕士研究生导师。2011年度获得“校先进单位”光荣称号。现有《传染病防治》、《医学验光技术》2门省级精品课程，《诊断学》、《内科学》、《妇产科学》等5门校级精品课程。承担省级自然基金课题3项，山东省“十一五”教研课题5项，省教育厅、省科技局和市级科研课题35项，获省、市级优秀教学成果、科技进步奖39项。发表学术论文300篇，其中在SCI及核心期刊上发表56篇。主编、参编全国规划教材6部，其他专著62部。

现设15个教研室：内科学教研室、诊断学教研室、外科学教研室、妇产科学教研室、儿科学教研室、中医学教研室、儿保教研室、妇保教研室、康复医学教研室、眼科学教研室、视光学教研室、耳鼻喉教研室、麻醉学教研室、传染病学教研室、皮肤性病学教研室，承担学校各专业多门课程的教学任务。

临床医学系始终坚持工学结合的职业教育理念，注重临床实践教学，融教学作为一体，配有完善的校内外实验实训基地。校内实训基地使用面积3000余m2，有先进的教学仪器设备300余台件，价值近600万元。设有心肺听诊实训室、胸腹部触诊实训室、外科更衣洗手室、模拟手术室、动物手术室、多媒体诊断实训室、临床综合技能实训室、心肺听诊复苏实训室、临床急救实训室、检体实训室，OT实训室、PT实训室、针灸实训室、推拿实训室、模拟分娩实训室、妇产科技能实训室等共20余个实训基地，多方位提高学生的职业技能。校外实习基地有学校附属医院、临沂市人民医院、沂水中心医院、临沂市妇幼保健院等37所省、市、县级医院，基本满足了临床教学实习、见习的需要。

近年来不断探索新的医学教育模式，注重理论与实践教学，走产学研结合之路，构建了校院合作的“2+1”或“1+2”以及后续“3+2”全科执业助理医师人才培养模式。先后与临沂市妇幼保健院、山东鲁南眼科医院开展校院合作办学，成立临床医学专业特色教学班，融临床教学、见习、实习和就业合作为一体化高职教学特色，培养学生较强的实践操作能力，取得较好效果。

目前，许多毕业生已成为医疗卫生战线上的业务骨干，有的已成为医学界的知名专家或领导，近年来不断探索专业与市场需求相接轨，毕业生就业率较高，近三年来就业率均在90%以上。部分专业毕业生供不应求，如临床医学专业眼视光方向和康复医学方向。

重视专科和本科教育的衔接，在课程设置上充分体现了学生专升本的需求，为学生参加专升本考试提供了知识、能力、素质等保证。升本人数每年均占专业招收总人数的30%以上，位于全省同类院校前列。